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Honegger, R (2015). Vom Zauber einer verborgenen Schatzkammer. Zürich, Switzerland: Universität Zürich, Institut für Pflanzenbiologie.

Honegger, R. Faszinierende Kopfweiden. In: Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 1 July 2014, p.n/a.

Honegger, R. Kiwi und andere Strahlengriffelgewächse. In: Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 1 January 2014.

Honegger, R. Kiwi und andere Strahlengriffelgewächse. In: Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 48/1, 2014, p.1-2.

Honegger, R. Ananas: Königin der Früchte. In: Gartenbriefe. Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 47/1, 2013, p.1-2.

Honegger, R. Elias Landolt (24. Juli 1926 - 1. April 2013) Prof. Dr. sc. nat. ETH. In: Vierteljahresschrift der Naturforschenden Gesellschaft in Zürich, 158, 2013, p.105-106.

Honegger, R. In Memoriam Elias Landolt (Beiblatt zu den Briefen aus dem Botanischen Garten). In: Gartenbriefe. Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 47/3, 2013, p.S1-S2.

Honegger, R (2012). Aino Marjatta Henssen (1925–2011). Bryologist, 115(2):350-353.

Honegger, R (2012). Faszinierendes Reich der Pilze. Weder Tier noch Pflanze. 4 bis 8 - Fachzeitschrift für Kindergarten und Unterstufe, (6):16-19.

Honegger, R (2012). In Memoriam. Nicolaas Christianus Johannes (Nico) Duijvestijn (1941-2012). Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich:1.

Honegger, R (2012). The symbiotic phenotype of lichen-forming ascomycetes and their endo- and epibionts. In: Hock, Bertold. Fungal Associations. Berlin, Heidelberg: Springer, 287-339.

Honegger, R (2012). Zauberhafte Zitrusfrüchte (Citrus-Arten). Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 46(1):1-2.

Honegger, R (2010). In memoriam Prof. Dr. Heinrich Zoller (1923-2009). Meylania, 44:35-37.

Itten, B; Honegger, R (2010). Population genetics in the homothallic lichen-forming ascomycete Xanthoria parietina. The Lichenologist, 42(06):751-761.

Honegger, R (2010). Weltenbummlerin Kokosnuss. Briefe aus dem Botanischen Garten Zürich, 44(1):1-2.

Tomescu, A M F; Rothwell, G W; Honegger, R (2009). A new genus and species of filamentous microfossil of cyanobacterial affinity from Early Silurian fluvial environments (lower Massanutten Sandstone, Virginia, USA). Botanical Journal of the Linnean Society, 160(3):284-289.

Roney, B R; Renhui, L; Banack, S A; Murch, S; Honegger, R; Cox, P A (2009). Consumption of fa cai Nostoc soup: a potential for BMAA exposure from Nostoc cyanobacteria in China? Amyotrophic Lateral Sclerosis, 10(Suppl.):44-49.

Honegger, R (2009). Flechten: ökologische Aspekte der Wechselbeziehung zwischen Pilz und Alge. In: Bayerische Akademie der Wissenschaften, München. Ökologische Rolle der Flechten. München: Verlag Dr. Friedrich Pfeil, 25-41.

Honegger, R (2009). Lichen-forming fungi and their photobionts. In: Deising, H. Plant relationships, 2nd ed. Berlin: Springer, 305-333.

Honegger, R (2009). Pflanzliches Elfenbein bei Dattel, Taguanuss & Co. Zürich: Botanischer Garten.

Tomescu, A M F; Honegger, R; Rothwell, G W (2008). Earliest fossil record of bacterial-cyanobacterial mat consortia: the early Silurian Passage Creek biota (440 Ma, Virginia, USA). Geobiology, 6(2):120-124.

Honegger, R; Aptroot, A (2008). Flechten im Botanischen Garten Zürich : 2008: 175 Jahre Universität Zürich : unser Beitrag zum Thema Wissen teilen. Zürich, CH: Vereinigung Freunde des Botanischen Gartens Zürich.

Honegger, R (2008). Morphogenesis. In: Nash, T H. Lichen biology (2nd ed.). Cambridge, UK: Cambridge University Press, 69-93.

Honegger, R (2008). Mycobionts. In: Nash, T H. Lichen biology (2nd ed.). Cambridge, UK: Cambridge University Press, 27-39.

Honegger, R; Scherrer, S (2008). Sexual reproduction in lichen-forming ascomycetes. In: Nash, T H. Lichen biology (2nd ed.). Cambridge, UK: Cambridge University Press, 94-103.

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