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Charakterisierung haemophiler Bakterienisolate der Gattungen Histophilus und Haemophilus aus Wiederkäuern


Sutter, Gabriella. Charakterisierung haemophiler Bakterienisolate der Gattungen Histophilus und Haemophilus aus Wiederkäuern. 2016, University of Zurich, Vetsuisse Faculty.

Abstract

Haemophile Bakterien der Gattungen Haemophilus und Histophilus sind bei Nutztieren weit verbreitet. Beim Wiederkäuer gilt Histophilus somni (syn. Haemophilus somnus) unter anderem als Verursacher der ISTME/TEME. Gleichzeitig werden diese Bakterien oft als asymptomatische Besiedler von Schleimhäuten des Genital- und Respirationstrakts gefunden. In der vorliegenden Arbeit wurden 194 Histophilus/Haemophilus-Isolate aus der Stammsammlung der Vetsuisse-Fakultät Zürich (1974 bis 1998) untersucht. Als Methoden wurden Kultur, 16S rDNA Amplifizierung und Sequenzierung sowie Ribotypisierung verwendet. Kulturell typisiert werden konnten 13 Isolate, die alle nicht hämolysierend, Oxidase-positiv, Katalase-negativ und V- und X-Faktor unabhängig waren. Aufgrund ihrer Koloniemorphologie wurden die Isolate der M-, S- und R-Form zugeordnet. Die Analyse der 16S rDNA aus 28 haemophilen Isolaten mit Datenbankeinträgen ergab für alle Isolate eine höchste Übereinstimmung mit 16S rDNA-Sequenzen von Histophilus somni-Isolaten. Aufgrund der unterschiedlichen Übereinstimmungsraten wurde eine Unterteilung in drei 16S rDNA-Gruppen vorgenommen. Interessanterweise wiesen 13 der 28 untersuchten Isolate (46,4%) eine Übereinstimmung von <95% mit bekannten Histophilus somni-Isolaten auf. Ob somit eine neue Spezies-Bestimmung zu erfolgen hat, wird Thema künftiger Untersuchungen sein. Alle untersuchten Isolate wiesen eine grosse genetische Vielfalt auf, wie sie auch in der Literatur beschrieben ist.

Haemophilic bacteria of the genera Haemophilus and Histophilus are found worldwide in a wide range of animals. In ruminants, Histophilus somni (syn. Haemophilus somnus) is for example known as causative agent of ISTME/TEME. Simultaneously, asymptomatic carrier animals are described where these bacteria colonize the mucosa of the genital and respiratory tract. In the present work, 194 Histophilus/Haemophilus isolates derived from the bacterial type collection of the Vetsuisse Faculty Zurich (1974 to 1998) were investigated. Culture methods, 16S rDNA amplification and sequencing as well as ribotyping were applied. By using culture based methods, 13 isolates did not show hemolysis and were oxidase positive, catalase negative and did not require V or X factors. Based on the colony morphology the isolates were assigned to the M, S and R colony type. Comparison of the 16S rDNA sequences to databank entries revealed the highest agreement (identity rates) with 16S rDNA sequences of Histophilus somni isolates. Based on the sequence differences in the 16S rDNA sequences the Histophilus isolates were grouped into three 16S rDNA groups. Interestingly, the identities of 13 of the 28 isolates (46.4%) with 16S rDNA sequences of published sequences were below 95%. Whether this low agreement rates could be the basis for a new species affiliation should be the goal of future studies. All isolates were found to be highly variable, a fact that was also described in the published literature.

Abstract

Haemophile Bakterien der Gattungen Haemophilus und Histophilus sind bei Nutztieren weit verbreitet. Beim Wiederkäuer gilt Histophilus somni (syn. Haemophilus somnus) unter anderem als Verursacher der ISTME/TEME. Gleichzeitig werden diese Bakterien oft als asymptomatische Besiedler von Schleimhäuten des Genital- und Respirationstrakts gefunden. In der vorliegenden Arbeit wurden 194 Histophilus/Haemophilus-Isolate aus der Stammsammlung der Vetsuisse-Fakultät Zürich (1974 bis 1998) untersucht. Als Methoden wurden Kultur, 16S rDNA Amplifizierung und Sequenzierung sowie Ribotypisierung verwendet. Kulturell typisiert werden konnten 13 Isolate, die alle nicht hämolysierend, Oxidase-positiv, Katalase-negativ und V- und X-Faktor unabhängig waren. Aufgrund ihrer Koloniemorphologie wurden die Isolate der M-, S- und R-Form zugeordnet. Die Analyse der 16S rDNA aus 28 haemophilen Isolaten mit Datenbankeinträgen ergab für alle Isolate eine höchste Übereinstimmung mit 16S rDNA-Sequenzen von Histophilus somni-Isolaten. Aufgrund der unterschiedlichen Übereinstimmungsraten wurde eine Unterteilung in drei 16S rDNA-Gruppen vorgenommen. Interessanterweise wiesen 13 der 28 untersuchten Isolate (46,4%) eine Übereinstimmung von <95% mit bekannten Histophilus somni-Isolaten auf. Ob somit eine neue Spezies-Bestimmung zu erfolgen hat, wird Thema künftiger Untersuchungen sein. Alle untersuchten Isolate wiesen eine grosse genetische Vielfalt auf, wie sie auch in der Literatur beschrieben ist.

Haemophilic bacteria of the genera Haemophilus and Histophilus are found worldwide in a wide range of animals. In ruminants, Histophilus somni (syn. Haemophilus somnus) is for example known as causative agent of ISTME/TEME. Simultaneously, asymptomatic carrier animals are described where these bacteria colonize the mucosa of the genital and respiratory tract. In the present work, 194 Histophilus/Haemophilus isolates derived from the bacterial type collection of the Vetsuisse Faculty Zurich (1974 to 1998) were investigated. Culture methods, 16S rDNA amplification and sequencing as well as ribotyping were applied. By using culture based methods, 13 isolates did not show hemolysis and were oxidase positive, catalase negative and did not require V or X factors. Based on the colony morphology the isolates were assigned to the M, S and R colony type. Comparison of the 16S rDNA sequences to databank entries revealed the highest agreement (identity rates) with 16S rDNA sequences of Histophilus somni isolates. Based on the sequence differences in the 16S rDNA sequences the Histophilus isolates were grouped into three 16S rDNA groups. Interestingly, the identities of 13 of the 28 isolates (46.4%) with 16S rDNA sequences of published sequences were below 95%. Whether this low agreement rates could be the basis for a new species affiliation should be the goal of future studies. All isolates were found to be highly variable, a fact that was also described in the published literature.

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Item Type:Dissertation (monographical)
Referees:Bleul U, Hölzle L E
Communities & Collections:05 Vetsuisse Faculty > Institute of Food Safety and Hygiene
05 Vetsuisse Faculty > Veterinary Clinic > Department of Farm Animals
UZH Dissertations
Dewey Decimal Classification:630 Agriculture
Uncontrolled Keywords:Ruminants, haemophilic, Histophilus somni, 16S rDNA
Language:German
Place of Publication:Zürich
Date:2016
Deposited On:16 Jan 2017 12:11
Last Modified:07 Apr 2020 06:59
Number of Pages:89
OA Status:Green
Related URLs:https://www.recherche-portal.ch/permalink/f/5u2s2l/ebi01_prod010734116 (Library Catalogue)

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Language: German
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