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Diskriminatorische Potenz molekularbiologischer Methoden zur Untersuchung der Epidemiologie der Coxiellose in der Schweiz


Reussner, Birgit. Diskriminatorische Potenz molekularbiologischer Methoden zur Untersuchung der Epidemiologie der Coxiellose in der Schweiz. 2009, University of Zurich, Vetsuisse Faculty.

Abstract

Zusammenfassung   

Zusammenfassung    Coxiella  burnetii  (Cb),  ein  gram‐negatives  und  obligat  intrazelluläres  Stäbchenbakterium,  verursacht  v.a.  Aborte  bei  Hauswiederkäuern  und  grippeähnliche  Erkrankungen  beim  Menschen. Die Coxiellose tritt in der Schweiz, beim Rind häufig auf. Ziel dieser Arbeit war es,  molekulare Methoden zur Identifizierung und Charakterisierung von Cb an Zellkulturisolaten  und  Feldproben  zu  validieren  und  diese  Methoden  im  Hinblick  auf  ihre  Anwendbarkeit  für  die  Routinediagnostik  zu  evaluieren.  Zur  Anwendung  kamen  eine  universelle  PCR  zur  Amplifizierung  der  16S  rDNA  sowie  7  verschiedene  Cb‐spezifische  PCRs.  Durch  die  Analyse  der 16S rDNA mittels Sequenzierung konnten die Zellkulturisolate (n=87) in 7 Gruppen, die  Feldproben  (n=13)  in  5  Gruppen  eingeteilt  werden.  Interessanterweise  war  in  einigen  Gruppen  die  Homologie  mit  bekannten  Cb‐16S  rDNA‐Sequenzen  unter  97%,  was  einen  Hinweis  auf  das  Auftreten  von  genetischen  Subtypen  gibt.  Auch  die  adaA‐  und  ISIIII‐PCR  eigneten sich zur Gruppierung von unseren Cb‐Isolaten. Das Sporulationsgen konnte nur in  28 der untersuchten Coxiellen nachgewiesen werden.   455  Seren  von  kleinen  Wiederkäuern  aus  dem  Kanton  Zürich  wurden  mittels  ELISA  auf  Antikörper gegen Cb untersucht. Die gefundene Seroprävalenz von 1,76% zeigt, dass kleine  Wiederkäuer  auch  in  der  Schweiz  als  potentielle  Infektionsquelle  für  den  Menschen  angesehen werden können.        



3    Summary 

Summary    Coxiella burnetii (Cb), a small gram‐negative and obligate intracellular rod, causes abortion in  ruminants and influenza‐like diseases in humans. In Switzerland, Coxiellosis often appears in  cattle.  The  aim  of  this  study  was  to  validate  molecular  methods  for  identification  and  characterization of Cb‐cell culture isolates and field samples, and to evaluate these methods  for routine diagnostics. A universal PCR for 16S rDNA amplification and seven different Cb‐ specific PCRs were performed. By sequencing the 16S rDNA, the cell culture isolates (n=87)  were divided into 7 groups and the field samples (n=13) into 5 groups. Surprisingly, in some  of  these  groups,  the  homology  among  the  known  Cb‐16S rDNA  sequences  was  less  than  97%, which suggests the presence of genomic subtypes. In addition, the adaA‐ and ISIIII‐PCR  were  suitable  for  inclusion  in  our  Cb‐isolates‐grouping.  The  sporulation  gene  was  detected  only in 28 of the isolates examined.  Sera of 455 small ruminants from the canton of Zurich were tested for antibodies against Cb  by  ELISA.  The  resulting  seroprevalence  of  1.76  %  suggests  that  small  ruminants  are  a  potential infection source for humans, in Switzerland.         



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Abstract

Zusammenfassung   

Zusammenfassung    Coxiella  burnetii  (Cb),  ein  gram‐negatives  und  obligat  intrazelluläres  Stäbchenbakterium,  verursacht  v.a.  Aborte  bei  Hauswiederkäuern  und  grippeähnliche  Erkrankungen  beim  Menschen. Die Coxiellose tritt in der Schweiz, beim Rind häufig auf. Ziel dieser Arbeit war es,  molekulare Methoden zur Identifizierung und Charakterisierung von Cb an Zellkulturisolaten  und  Feldproben  zu  validieren  und  diese  Methoden  im  Hinblick  auf  ihre  Anwendbarkeit  für  die  Routinediagnostik  zu  evaluieren.  Zur  Anwendung  kamen  eine  universelle  PCR  zur  Amplifizierung  der  16S  rDNA  sowie  7  verschiedene  Cb‐spezifische  PCRs.  Durch  die  Analyse  der 16S rDNA mittels Sequenzierung konnten die Zellkulturisolate (n=87) in 7 Gruppen, die  Feldproben  (n=13)  in  5  Gruppen  eingeteilt  werden.  Interessanterweise  war  in  einigen  Gruppen  die  Homologie  mit  bekannten  Cb‐16S  rDNA‐Sequenzen  unter  97%,  was  einen  Hinweis  auf  das  Auftreten  von  genetischen  Subtypen  gibt.  Auch  die  adaA‐  und  ISIIII‐PCR  eigneten sich zur Gruppierung von unseren Cb‐Isolaten. Das Sporulationsgen konnte nur in  28 der untersuchten Coxiellen nachgewiesen werden.   455  Seren  von  kleinen  Wiederkäuern  aus  dem  Kanton  Zürich  wurden  mittels  ELISA  auf  Antikörper gegen Cb untersucht. Die gefundene Seroprävalenz von 1,76% zeigt, dass kleine  Wiederkäuer  auch  in  der  Schweiz  als  potentielle  Infektionsquelle  für  den  Menschen  angesehen werden können.        



3    Summary 

Summary    Coxiella burnetii (Cb), a small gram‐negative and obligate intracellular rod, causes abortion in  ruminants and influenza‐like diseases in humans. In Switzerland, Coxiellosis often appears in  cattle.  The  aim  of  this  study  was  to  validate  molecular  methods  for  identification  and  characterization of Cb‐cell culture isolates and field samples, and to evaluate these methods  for routine diagnostics. A universal PCR for 16S rDNA amplification and seven different Cb‐ specific PCRs were performed. By sequencing the 16S rDNA, the cell culture isolates (n=87)  were divided into 7 groups and the field samples (n=13) into 5 groups. Surprisingly, in some  of  these  groups,  the  homology  among  the  known  Cb‐16S rDNA  sequences  was  less  than  97%, which suggests the presence of genomic subtypes. In addition, the adaA‐ and ISIIII‐PCR  were  suitable  for  inclusion  in  our  Cb‐isolates‐grouping.  The  sporulation  gene  was  detected  only in 28 of the isolates examined.  Sera of 455 small ruminants from the canton of Zurich were tested for antibodies against Cb  by  ELISA.  The  resulting  seroprevalence  of  1.76  %  suggests  that  small  ruminants  are  a  potential infection source for humans, in Switzerland.         



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Additional indexing

Item Type:Dissertation (monographical)
Referees:Hoelzle Ludwig E, Hässig M
Communities & Collections:UZH Dissertations
Dewey Decimal Classification:570 Life sciences; biology
Language:German
Place of Publication:Zürich
Date:2009
Deposited On:09 Mar 2009 07:44
Last Modified:28 Oct 2019 08:11
Number of Pages:57
OA Status:Green
Related URLs:https://www.recherche-portal.ch/primo-explore/fulldisplay?docid=ebi01_prod005782334&context=L&vid=ZAD&search_scope=default_scope&tab=default_tab&lang=de_DE (Library Catalogue)

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