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Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis prevalence studies in bulk tank raw milk and slaughtered healthy dairy cows in Switzerland using an F57 sequence-based real-time PCR assay


Bosshard, Corinne. Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis prevalence studies in bulk tank raw milk and slaughtered healthy dairy cows in Switzerland using an F57 sequence-based real-time PCR assay. 2006, University of Zurich, Vetsuisse Faculty.

Abstract

Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine auf dem Zielgen MAP F57 basierende real-time PCR Methode angewendet, um die Prävalenz von M. avium subsp. paratuberculosis (MAP) in Bestandesrohmilchproben und in Proben, die von geschlachteten Milchkühen erhoben wurden, zu bestimmen. Die minimale Nachweisgrenze des verwendeten Vorgehens liegt im Bereich von 100-1000 MAP pro 10 ml Milch und bei 10-100 MAP pro 200 mg Kot.Von den 100 getesteten Bestandesmilchproben waren 3 Proben (3%) M. avium subsp. paratuberculosis DNA-positiv. Von den geschlachteten Milchkühen waren 8.9% (9/101) der Kotproben, 4.9% (5/101) der Mesenteriallymphknoten, 0.9% (1/101) der Ileumproben, 3.6% (3/84) der Einzeltiermilchproben und 2.9% (3/101) der Zwerchfellmuskulaturproben M. avium subsp. paratuberculosis positiv. Nur von einem Tier waren jedoch mehr als eine Probe positiv.Diese Arbeit liefert im Rahmen von zwei Feldstudien erstmals Prävalenzdaten zu M. avium subsp. paratuberculosis in der Schweiz mittels eines F57 basierten PCR Systems und zeigt gleichzeitig die Anwendbarkeit dieses RT-PCR Systems bei verschiedenen Probenmatrices auf. Das Vorkommen von M. avium subsp. paratuberculosis wurde auch mit diesem neuen approach sowohl in Bestandesrohmilchproben als auch in Proben von geschlachteten Milchkühen bestätigt.

A light cycler-based real-time PCR assay that targets the F57 sequence was used to monitor the prevalence of M. avium subsp. paratuberculosis in Swiss bulk tank raw milk and in a population of healthy slaughtered dairy cattle.The assay's minimal detection limits were in the range of 100-1000 cells per 10 ml of milk and about 10- 100 cells per 200 mg of feces. Amongst the 100 bulk tank milk samples that were tested, we found 3 samples (3%) that were positive for M. avium subsp. paratuberculosis. Amongst the slaughtered healthy dairy cattle, 8.9% (9/101) of the cows were positive for M. avium subsp. paratuberculosis DNA in their fecal samples, 4.9% (5/101) in their mesenteric lymph nodes, 0.9% (1/101) in their ileum tissue, 3.6% (3/84) in their milk and 2.9% (3/101) were positive in their diaphragmatic muscles.This study reports the first set of prevalence data on M. avium subsp. paratuberculosis organisms in Switzerland that are based on a F57 sequence targeting PCR system. M. avium subsp. paratuberculosis presence in both bulk tank raw milk and in slaughtered healthy dairy cattle is confirmed. This finding may be of relevance to public health in view of milk and beef products as potential vehicles of M. avium subsp. paratuberculosis transmission to humans in the context of the unresolved potential link of these microorganisms to some cases of human Crohn's disease.

Abstract

Im Rahmen dieser Arbeit wurde eine auf dem Zielgen MAP F57 basierende real-time PCR Methode angewendet, um die Prävalenz von M. avium subsp. paratuberculosis (MAP) in Bestandesrohmilchproben und in Proben, die von geschlachteten Milchkühen erhoben wurden, zu bestimmen. Die minimale Nachweisgrenze des verwendeten Vorgehens liegt im Bereich von 100-1000 MAP pro 10 ml Milch und bei 10-100 MAP pro 200 mg Kot.Von den 100 getesteten Bestandesmilchproben waren 3 Proben (3%) M. avium subsp. paratuberculosis DNA-positiv. Von den geschlachteten Milchkühen waren 8.9% (9/101) der Kotproben, 4.9% (5/101) der Mesenteriallymphknoten, 0.9% (1/101) der Ileumproben, 3.6% (3/84) der Einzeltiermilchproben und 2.9% (3/101) der Zwerchfellmuskulaturproben M. avium subsp. paratuberculosis positiv. Nur von einem Tier waren jedoch mehr als eine Probe positiv.Diese Arbeit liefert im Rahmen von zwei Feldstudien erstmals Prävalenzdaten zu M. avium subsp. paratuberculosis in der Schweiz mittels eines F57 basierten PCR Systems und zeigt gleichzeitig die Anwendbarkeit dieses RT-PCR Systems bei verschiedenen Probenmatrices auf. Das Vorkommen von M. avium subsp. paratuberculosis wurde auch mit diesem neuen approach sowohl in Bestandesrohmilchproben als auch in Proben von geschlachteten Milchkühen bestätigt.

A light cycler-based real-time PCR assay that targets the F57 sequence was used to monitor the prevalence of M. avium subsp. paratuberculosis in Swiss bulk tank raw milk and in a population of healthy slaughtered dairy cattle.The assay's minimal detection limits were in the range of 100-1000 cells per 10 ml of milk and about 10- 100 cells per 200 mg of feces. Amongst the 100 bulk tank milk samples that were tested, we found 3 samples (3%) that were positive for M. avium subsp. paratuberculosis. Amongst the slaughtered healthy dairy cattle, 8.9% (9/101) of the cows were positive for M. avium subsp. paratuberculosis DNA in their fecal samples, 4.9% (5/101) in their mesenteric lymph nodes, 0.9% (1/101) in their ileum tissue, 3.6% (3/84) in their milk and 2.9% (3/101) were positive in their diaphragmatic muscles.This study reports the first set of prevalence data on M. avium subsp. paratuberculosis organisms in Switzerland that are based on a F57 sequence targeting PCR system. M. avium subsp. paratuberculosis presence in both bulk tank raw milk and in slaughtered healthy dairy cattle is confirmed. This finding may be of relevance to public health in view of milk and beef products as potential vehicles of M. avium subsp. paratuberculosis transmission to humans in the context of the unresolved potential link of these microorganisms to some cases of human Crohn's disease.

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Item Type:Dissertation (monographical)
Referees:Stephan Roger, Salman Mo
Communities & Collections:UZH Dissertations
Dewey Decimal Classification:Unspecified
Language:English
Place of Publication:Zürich
Date:2006
Deposited On:12 Jun 2019 12:05
Last Modified:12 Jun 2019 12:05
Number of Pages:37
OA Status:Green
Related URLs:https://www.recherche-portal.ch/primo-explore/fulldisplay?docid=ebi01_prod005171775&context=L&vid=ZAD&search_scope=default_scope&tab=default_tab&lang=de_DE (Library Catalogue)

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          PCR assay'.
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Language: English
Filetype: PDF
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