Publication: MLTreeMap - maximum likelihood placement of environmental DNA sequence reads into curated reference phylogenies
MLTreeMap - maximum likelihood placement of environmental DNA sequence reads into curated reference phylogenies
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Stark, M. (2011). MLTreeMap - maximum likelihood placement of environmental DNA sequence reads into curated reference phylogenies. (Dissertation, University of Zurich) https://doi.org/10.5167/uzh-59539
Abstract
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Bei der Erforschung von mikrobiellen Gemeinschaften in situ stösst die traditionelle Mikrobiologie an ihre Grenzen, weil nur ein verschwindend kleiner Teil der Mikroben in Reinkultur gezu! chtet werden kann. Die Idee diesen Engpass zu umgehen, indem man DNA direkt aus aus der Umwelt extrahiert und daraufhin sequenziert, fu! hrte zur Entstehung eines neuen Forschungsfeldes, der Metagenomik. Mit Hilfe des metagenomischen Ansatzes ist es möglich, objektive Informationen u! ber alle in einer Probe präsenten Mikroben zu erhalten. Ein gewic
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